2016年8月15日,,《自然-遺傳學(xué)》(Nature Genetics)雜志在線發(fā)表了中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所王曉武研究組和北京百邁客生物科技有限公司合作的最新研究成果,。該研究最主要的成果是國際上首次發(fā)現(xiàn)全基因組三倍化事件是導(dǎo)致蕓薹類物種的形態(tài)型多樣化以及趨同馴化的原因;此外挖掘出兩個(gè)重要的商業(yè)性狀——葉片結(jié)球性狀和塊莖形態(tài)性狀的重要調(diào)控基因,為今后的分子育種工作提供遺傳基礎(chǔ),。
基因組組裝時(shí)基因組研究項(xiàng)目中的核心,,而傳統(tǒng)的組裝手段,很難得到高質(zhì)量的基因組,?;蚪M測序是物種研究的基礎(chǔ)?;诨蚪M測序的分析功能研究,、進(jìn)化研究和比較基因組學(xué)研究,對于研究物種的功能,進(jìn)化,,遺傳育種,,改進(jìn)物種性狀有重要的作用?;蚪M研究中組裝是最為重要的一步,。目前大多數(shù)的基因組項(xiàng)目組裝采用的仍然是二代小片段數(shù)據(jù),常用的組裝方法也大多利用圖論的方法解決組裝難度較高區(qū)域,。然而對于基因組中的高雜合、高重復(fù)和高GC含量的區(qū)域,,傳統(tǒng)的測序技術(shù)和組裝方法難以高效解決,,嚴(yán)重的限制了基因組相關(guān)的研究。
2015年百邁客生物引入三代測序技術(shù),、光學(xué)圖譜技術(shù)和Hi-C掛載染色體測序技術(shù),,徹底解決組裝難題。三代測序技術(shù)測序長度在10-20k左右,,能直接跨過二代難組裝的區(qū)域,,能準(zhǔn)確的提升基因組的完整性。而三代光學(xué)圖譜利用全基因組拍照定位技術(shù)能夠?qū)⒔M裝的結(jié)果進(jìn)一步提升,,能夠顯著的提升各項(xiàng)指標(biāo),。而Hi-C技術(shù)通過染色體之間的互作,能夠?qū)⑿蛄兄苯訏燧d到染色體水平,。因此三代,、光學(xué)、Hi-C通力合作,,能夠?qū)⒒蚪M組裝水平顯著提升,。目前擁有全部三項(xiàng)技術(shù)的公司不多,百邁客生物在基因組測序平臺和技術(shù)上,,已經(jīng)走在了行業(yè)前沿,。百邁客生物科技引領(lǐng)contig 組裝N50進(jìn)入M級別,硬實(shí)力又有升級,。
擁有最新的全面的測序平臺上解讀基因組的基礎(chǔ),,更需要的是經(jīng)驗(yàn)豐富的技術(shù)團(tuán)隊(duì)。
百邁客人深耕基因組領(lǐng)域長達(dá)7年,,其中不乏精彩的成果和文章,,最近這兩篇高水平的文章發(fā)表,更彰顯了百邁客人深厚的實(shí)力和刻苦的鉆研精神,。目前在線的動植物基因組項(xiàng)目物種比較豐富,,形式也很多樣。復(fù)雜基因組占多數(shù),,組裝結(jié)果均超過了國際標(biāo)準(zhǔn)水平,。開發(fā)的二代軟件GNOVO有很好的組裝效果,,同時(shí)新的三代軟件研發(fā)已經(jīng)有突破性進(jìn)展,可以很大的提升植物基因組重復(fù)序列的組裝效果,。
領(lǐng)先的技術(shù)平臺,、豐富的技術(shù)分析和項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),百邁客人仍然不忘初心,,朝著打造中國標(biāo)志性生物企業(yè)的方向邁進(jìn),。百邁客生物科技,為世界創(chuàng)造無限可能,。